Oferuję pełną analizę bioinformatyczną danych RNA-seq:
1. Kontrola jakości surowych odczytów (FastQC, MultiQC)
2. Trimming adapterów (Trimmomatic / fastp)
3. Alignment do genomu referencyjnego (STAR / HISAT2)
4. Zliczanie odczytów (featureCounts)
5. Analiza różnicowej ekspresji genów (DESeq2 / edgeR)
6. Analiza wzbogacenia ścieżek (GO, KEGG, Reactome)
7. Wizualizacje: volcano plot, heatmap, PCA, MA plot
Dostarczam:
– Kod pipeline (Nextflow / Snakemake) do odtworzenia analizy
– Interaktywny raport HTML z wynikami
– Tabele wynikowe (CSV/Excel)
– Krótkie podsumowanie pisemne
Czas realizacji: 5-10 dni roboczych w zależności od wielkości datasetu.